根据省委省政府工作部署海南省财金集团出资设立海南自由贸易港创新投资基金（简称：自贸港创新基金） 引导社会资本支持海南自贸港创新创业的高质量发展。自贸港创新基金按照“政府引导、市场运作、科学决策、防范风险、支小支微”的原则，重点服务于符合自贸港产业定位的种子期、初创期企业及专精特新中小企业的引进、培育和发展。

自贸港创新基金首期规模10亿元人民币，由两只独立运作的母基金自贸港创新基金壹号、贰号组成，首期规模各5亿元。截至2024年末，自贸港创新基金已设立2只子基金，子基金总认缴规模3亿元。